南京市开放实验室2012年被南京市科技局批准为市级高校开放实验室，2016年获得南京市经济和信息化委员会《南京市新兴产业引导专项资金项目》的资助。目前南京市开放实验室的依托主体是中国药科大学基础医学与临床药学学院的主要科研实验平台，预约服务见基础医学与临床药学学院各服务平台的服务预约。

• 细胞与分子生物学实验平台

• 药学动物实验中心

• 江苏省肿瘤发生与干预重点实验室

• 国家科技部肿瘤药效学服务平台平台

• 江苏省中小企业新医药产业公共服务平台

• 天然药物活性物质功能研究实验室

• 临床药代动力学研究室